Onion Information

Page Clicks: 0

First Seen: 03/15/2024

Last Indexed: 09/18/2024

Domain Index Total: 397

Detaljni izvedbeni nastavni plan za kolegij: INFORMATIKA - Akademska godina: 2022./2023. Studij: Preddiplomski studij Biotehnologija i istraživanje lijekova Kod kolegija: BIL103 ECTS bodovi: 3 Jezik na kojem se izvodi kolegij: Hrvatski Nastavno opterećenje kolegija: 30 sati (10P + 20V) Preduvjeti za upis kolegija: Nema - Nositelj kolegija i kontakt podaci - Titula i ime: Dejan Ljubobratović, pred. Adresa: Ulica Radmile Matejčić 2 , soba O-522 Telefon: 051/584-724 E-mail: dejan.ljubobratovic@inf.uniri.hr Web stranica: portal.uniri.hr - Vrijeme konzultacija - Nakon nastave ili po dogovoru e-mailom. Izvođači i nastavna opterećenja (suradnici, asistenti, tehničar/laborant) - Dejan Ljubobratović, pred. (10P + 20V x 2 grupe) - Obavezna literatura - Preporučena dodatna literatura (izborna) - Opis predmeta (sažetak i ciljevi kolegija) - Kolegij je namijenjen pripremi studenata biotehnologije za obrade podataka iz tog područja. Kao takav, sadržaj kolegija je usmjeren na: Ishodi učenja - Po završetku kolegija studenti će moći: Detaljni sadržaj kolegija (teme/naslovi predavanja, seminara i vježbi) - Predavanja - P1. (2 h) Povijesni razvoj računala. Sklopovska i programska oprema P2. (2 h) Povijesni razvoj interneta i operacijskih sustava. Znanstvena programska oprema P3. (2 h) Superračunala. Trendovi i smjerovi razvoja informacijske i komunikacijske tehnologije P4. (2 h) Intelektualno vlasništvo nad programskom opremom i podacima. Licenciranje P5. (2 h) Računalna kemija, molekularno modeliranje i bioinformatika - Vježbe - V1. (4 h) Obrada dokumenata koji sadrže kemijske molekularne formule i jednadžbe ( Visual Studio Code , Live Share , Markdown , Marp , MathJax , KaTeX , mhchem , chemfig , Pandoc , LibreOffice ) V2. (4 h) Rad s osnovnim funkcijama i postavljanje operacijskog sustava ( Windows Subsystem for Linux , Ubuntu , Debian , FreeBSD ). Osnove programiranja ( Python , Visual Studio Code , Python extension for Visual Studio Code ) V3. (4 h) Crtanje strukturnih formula i računanje osnovnih svojstava molekula ( RDKit ) V4. (4 h) Baze podataka i postojeća programska podrška u računalnoj kemiji, molekularnom modeliranju i bioinformatici ( KEGG , ChEMBL , RCSB PDB , UniProt , GPCRdb , Avogadro , Open Babel , PyMOL , UGENE ) V5. (4 h) Simboličko računanje ( SymPy ). Numeričko računanje ( NumPy ). Crtanje grafova ( Matplotlib ). Obrada strukturiranih podataka ( pandas ) - Obveze, način praćenja i vrednovanje studenata - Pohađanje nastave - Pohađanje nastave je obavezno i nastavnici vode evidenciju pohađanja za svakoga studenta. Predavanja se izvode u bloku od 2 sata prema rasporedu. Vježbe se izvode na računalima u bloku od 4 sata prema rasporedu. Na vježbama studenti trebaju usvojiti korištenje računarskih sustava koja se koriste u biotehnologiji. Osim prisustvovanja online nastavi na predavanjima i vježbama studenti su dužni koristiti e-sustav za učenje Merlin ( moodle.srce.hr/2022-2023/ ). Seminarski rad - Seminarski rad podrazumijeva izradu prezentacije samostalno ili u paru korištenjem markup jezika Markdown na odabranu temu iz područja studija o kojoj će se sadržaji prikupiti pretraživanjem weba i izraditi korištenjem programskih alata za računalnu kemiju, molekularno modeliranje i bioinformatiku obrađenih na vježbama. Bodovat će se kvaliteta, sadržaj i aktualnost obrađene teme. Ova aktivnost nosi do maksimalno 20 ocjenskih bodova. Provjera znanja - Provjera znanja uključuje gradivo obrađeno na predavanjima, izvodi se u obliku testa na sustavu za učenje Merlin i nosi do maksimalno 30 ocjenskih bodova. Završni ispit - Završni ispit polaže se na računalima i uključuje rješavanje praktičnih zadataka s vježbi. Ispit nosi udio od maksimalno 50 ocjenskih bodova, a smatra se položenim samo ako na njemu student postigne minimalno 50%-ni uspjeh (ispitni prag je 50% točno odgovorenih pitanja i uspješno riješenih zadataka). Na prethodno opisani način (seminarski rad, pisana provjera znanja i završni ispit) studenti mogu skupiti 100 ocjenskih bodova. Ispitni rokovi - 1. ispitni rok održat će se 30. 06. 2023. u O-365 s početkom u 09:00. 2. ispitni rok održat će se 14. 07. 2023. u O-365 s početkom u 09:00. 3. ispitni rok održat će se u rujnu prema dogovoru sa studentima. 4. ispitni rok održat će se u rujnu prema dogovoru sa studentima. Formiranje ocjene (prema Pravilniku o studijima Sveučilišta u Rijeci) - Studenti tijekom kontinuirane nastave mogu steći maksimalno 50% ocjenskih bodova, a na završnom ispitu 50%. Studenti koji su tijekom kontinuiranog dijela nastave ostvarili: Prema postignutom ukupnom broju ocjenskih bodova dodjeljuju se sljedeće konačne ocjene: Konačna ocjena je zbroj bodova ostvarenih tijekom nastave i bodova ostvarenih na završnom ispitu, a prolazne ocjene su izvrstan (5), vrlo dobar (4), dobar (3) i dovoljan (2). Raspored nastave - Dodatne informacije - Izvođač nastave zadržava pravo izmjene rasporeda. Studenti će o eventualnim promjenama biti obaviješteni putem e-sustava za učenje. Mole se svi studenti da se odazovu vrednovanju kvalitete nastavnog rada nastavnika i suradnika kako bi se na temelju procjena i sugestija mogla unaprijediti nastava na ovom kolegiju. Vrednovanje nastave putem ISVU sustava provodi se aplikacijom Studomat na obrascu definiranom na razini Sveučilišta u Rijeci, a rezultati su anonimni. Više informacija o svim aspektima ovog procesa možete pronaći u Priručniku za kvalitetu studiranja Sveučilišta u Rijeci . Akademska čestitost - Studenti su dužni poštovati načela akademske čestitosti te se upućuju na dokumente Sveučilišta u Rijeci: Etički kodeks Sveučilišta u Rijeci te Etički kodeks za studente .