Onion Information
Baza bioaktivnih molekula ChEMBL - GASERI
ChEMBL je vrlo značajna baza kemijskih spojeva i drugih podataka (mete, eseji, dokumenti, stanice i tkiva)
Onion Details
Page Clicks: 0
First Seen: 03/15/2024
Last Indexed: 10/23/2024
Onion Content
Preskoči na sadržaj Baza bioaktivnih molekula ChEMBL je vrlo značajna baza kemijskih spojeva i drugih podataka (mete, eseji, dokumenti, stanice i tkiva). Pretraga Pretragom dobivamo rezultate koje možemo preuzeti kao CSV i TSV (datoteke u kojem su elementi retka odvojeni točkom i zarezom, odnosno znakom tabulatora, prikladne za obradu u tabličnom kalkulatoru ili alatu kao pandas ). Osim toga, možemo preuzeti SDF datoteku s rezultatima pretraživanja koju ćemo koristiti u alatima za vizualizaciju molekula (dobit ćemo datoteku komprimiranu GZIP-om, što na Windowsima možemo raspakirati korištenjem 7-Zipa ). Format SDF je vrlo popularan među softverima za molekularni docking, a nastao je kao proširenje formata MDL Molfile koje omogućuje dodavanje metapodataka o molekuli i pohranjivanje više molekula unutar jedne datoteke. Podaci o spoju Odabirom bilo kojeg rezultata pretrage dobit ćemo detaljan izvještaj o tom spoju (sliku, naziv(e), svojstva i dr.). Nama je zanimljiv dio Representations gdje možemo preuzeti spoj u formatima MDL Molfile (SDF sa samo jednim spojem u njemu) i SMILES . Zapis u formatu InChI je također dostupan, ali on nam rjeđe treba. Ostale baze slične namjene ChemSpider PubChem Author: Vedran Miletić