Onion Information

Page Clicks: 1

First Seen: 03/15/2024

Last Indexed: 10/23/2024

Domain Index Total: 397

Preskoči na sadržaj Znanstveni program mentora Naziv doktorskog studija: Sveučilišni poslijediplomski (doktorski) studij Informatika Potencijalni mentor Titula, ime i prezime: doc. dr. sc. Vedran Miletić Ustanova, država: Sveučilište u Rijeci , Hrvatska Odjel/odsjek: Fakultet informatike i digitalnih tehnologija CV: vedran.miletic.net i group.miletic.net E-pošta: vmiletic@inf.uniri.hr Područja znanstveno-istraživačkog rada mentora Heterogeno računarstvo (engl. heterogeneous computing ) Računarstvo visokih performansi (engl. high-performance computing ) Računarstvo u oblaku (engl. cloud computing ) Računalno modeliranje u fizici i kemiji (engl. computer modelling in physics and chemistry ) Znanstveno računanje (engl. scientific computing ) Nositeljstvo kolegija na doktorskom studiju Informatika Računalna biokemija i biofizika (engl. Computational biochemistry and biophysics ) Voditeljstvo i suradnja na tekućim projektima voditelj projekta DPU offload of force reduction calculations in molecular dynamics simulations (financiran od strane tvrtke NVIDIA) suradnik na projektu National Competence Centres in the framework of EuroHPC (EuroCC) (financiran u okviru EU programa Horizon 2020) Važniji radovi (u posljednjih 5 godina) Miletić, V. , Nikolić, P. & Kinkela, D. Structure-based Molecular Docking in the Identification of Novel Inhibitors Targeting SARS-CoV-2 Main Protease. in 2021 44th International Convention on Information, Communication, and Electronic Technology (MIPRO) , 435-440 (2021). doi:10.23919/MIPRO52101.2021.9596660 Svedružić, Ž. M, Vrbnjak, K., Martinović, M. & Miletić, V. Structural Analysis of the Simultaneous Activation and Inhibition of γ-Secretase Activity in the Development of Drugs for Alzheimer's Disease. Pharmaceutics 13 (4), 514 (2021). doi:10.3390/pharmaceutics13040514 ( WoS-SCIE, Q1 (2020), JIF: 6.321 (2020) ; times cited : 2) Miletić, V. , Ašenbrener Katić, M. & Svedružić, Ž. High-throughput Virtual Screening Web Service Development for SARS-CoV-2 Drug Design. in 2020 43rd International Convention on Information, Communication, and Electronic Technology (MIPRO) , 371-376 (2020). doi:10.23919/MIPRO48935.2020.9245082 Herrera-Rodríguez, A., Miletić, V. , Aponte-Santamaría, C. & Gräter, F. Molecular dynamics simulations of molecules in uniform flow. Biophys. J. 116 (6), 621-632 (2019). doi:10.1016/j.bpj.2018.12.025 ( WoS-SCIE, Q1, JIF: 3.854 ; times cited : 5) Franz, F., Aponte-Santamaría, C., Daday, C., Miletić, V. & Gräter, F. Stability of Biological Membranes upon Mechanical Indentation. J. Phys. Chem. B 122 (28), 7073-7079 (2018). doi:10.1021/acs.jpcb.8b01861 ( WoS-SCIE, Q2, JIF: 2.923 ; times cited : 2) Miletić, V. , Odorčić, I., Nikolić, P. & Svedružić, Ž. M. In silico design of the first DNA-independent mechanism-based inhibitor of mammalian DNA methyltransferase Dnmt1. PLOS ONE 12 (4), e0174410 (2017). doi:10.1371/journal.pone.0174410 ( WoS-SCIE, Q1, JIF: 2.766 ; times cited : 14) Okvirna područja istraživanja i tema doktorata Prilagodba aplikacija koje koriste Open Multi-Processing (OpenMP), Message Passing Interface (MPI) i paralelizam zasnovan na zadaćama za eksaskalarna superračunala Prilagodba metoda visokoprotočnog molekulskog probira i simulacije molekulske dinamike za izvođenje u računalnom oblaku Automatizacija tijeka rada i stvaranje cjevovoda za analizu molekula prema znanstvenoistraživačkim potrebama Primjena strojnog učenja u pripremi ulaznih podataka i obradi izlaznih podataka visokoprotočnog molekulskog probira i simulacije molekulske dinamike Primjena automatske paralelizacije programa od strane program-prevoditelja u heterogenim računalnim sustavima Author: Vedran Miletić