Onion Information

Page Clicks: 0

First Seen: 03/15/2024

Last Indexed: 10/23/2024

Domain Index Total: 397

Preskoči na sadržaj O grupi Info Ova je stranica također dostupna na engleskom jeziku . Grupa za aplikacije i usluge na eksaskalarnoj istraživačkoj infrastrukturi (engl. Group for Applications and Services on Exascale Research Infrastructure , kraće GASERI) je istraživačka, razvojna i nastavna jedinica na Fakultetu informatike i digitalnih tehnologija i Medicinskom fakultetu Sveučilišta u Rijeci . Uvodna prezentacija Svijetla pozadina Tamna pozadina Interesi Superračunalo, također poznato kao računalo visokih performansi (engl. high performance computer , kraće HPC), nudi mnogo veće performanse od osobnog računala. Performanse se obično mjere brojem operacija s pomičnim zarezom u sekundi (engl. floating-point operations per second , kraće FLOPS) koje računalo može izvesti; osobno računalo može izvesti do desetke teraFLOPS-a, dok moderni HPC-i mogu izvesti stotine petaFLOPS-a, što rezultira faktorom ubrzanja od otprilike deset tisuća. Takva su ubrzanja omogućena korištenjem modela paralelnog i distribuiranog programiranja. S performansama superračunala koje se približavaju exaFLOPS-u, arhitektura računala postaje sve heterogenija, dok su modeli programiranja sve složeniji. Konačno, HPC se sve više nudi kao usluga u oblaku, što predstavlja vlastiti skup izazova. Mnoga znanstvena područja ovise o korištenju superračunala za svoje izračune; posebno se računalna biokemija oslanja na superračunala za proučavanje i predviđanje strukture proteina, kao i njihove dinamike, funkcije i reaktivnosti s malim molekulama (ligandima). Glavni interes Grupe za aplikacije i usluge na eksaskalarnoj istraživačkoj infrastrukturi je primjena eksaskalarnog računarstva za rješavanje problema u računalnoj biokemiji. Cilj je dizajnirati algoritme boljih performansi i ponuditi njihove implementacije za akademsku i industrijsku upotrebu. Računalni kemičari koji imaju pristup boljim alatima mogu proučavati postojeće sustave brže, detaljnije ili umjesto njih proučavati veće sustave. Specifični fokusi u sadašnjosti su distribuirane arhitekture baza podataka kemijskih spojeva koje zadovoljavaju zahtjeve skalabilnosti i pouzdanosti visoko propusnih virtualnih pregleda, napredak algoritama molekulske dinamike koji im omogućuje učinkovito korištenje eksaskalarnih superračunalnih resursa te uspostavljanje hrvatskog centra kompetencija za HPC. Metode Grupa koristi i dalje razvija metode za predviđanje pristajanja liganda na protein, simulaciju molekularne dinamike, Monte Carlo metodu i druge računalne tehnike za proučavanje statičkih i dinamičkih svojstava biomolekulskih sustava. Interdisciplinarni pristup u grupi objedinjuje stručnost fizičara, matematičara, informatičara i računalnih znanstvenika. Temeljna motivacija je raditi bolju znanost na način otvorenog izbora; znanost je u suštini otvorena i takva bi trebala i ostati. Način otvorenog izvora uključuje otvorene formate datoteka, slobodni softver i softver otvorenog koda, otvoreni hardver, obrambeno licenciranje patenata i otvoreni pristup objavljenim radovima. Povijest Grupa je započela s radom u listopadu 2021. Izgrađena je na nasljeđu Laboratorija za računalne mreže, paralelizaciju i simulaciju (engl. Computer Networks, Parallelization, and Simulation Laboratory , kraće CNPSLab) koji je do listopada 2021. bio dio Odjela za informatiku . Na zasebnoj stranici možete pročitati više o povijesti grupe . Poster Preuzimanje u formatu PDF (A3, položeno) Author: Vedran Miletić